MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120delta

Total Repeats: 1043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003273	ATG	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003273	CCA	2	6	30	35	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_003273	A	8	8	103	110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003273	ACC	3	9	118	126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_003273	AAT	2	6	236	241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17232875
6	NC_003273	TGC	2	6	256	261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17232875
7	NC_003273	CAAA	2	8	268	275	75 %	0 %	0 %	25 %	17232875
8	NC_003273	CAA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232875
9	NC_003273	ACC	2	6	359	364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17232875
10	NC_003273	TAA	2	6	421	426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17232875
11	NC_003273	TCA	3	9	457	465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232875
12	NC_003273	CGT	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17232875
13	NC_003273	CTA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232875
14	NC_003273	CGC	2	6	662	667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17232875
15	NC_003273	CTTA	2	8	678	685	25 %	50 %	0 %	25 %	17232875
16	NC_003273	AG	3	6	694	699	50 %	0 %	50 %	0 %	17232875
17	NC_003273	TCT	2	6	703	708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17232875
18	NC_003273	AAC	2	6	773	778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232876
19	NC_003273	TACA	2	8	903	910	50 %	25 %	0 %	25 %	17232876
20	NC_003273	GAT	2	6	947	952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232876
21	NC_003273	GAA	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17232876
22	NC_003273	AGT	2	6	1352	1357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003273	TCA	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_003273	TGG	2	6	1367	1372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003273	ATG	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003273	ACT	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003273	A	6	6	1612	1617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003273	TCC	2	6	1622	1627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_003273	GCA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17232877
30	NC_003273	GAT	3	9	1768	1776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232877
31	NC_003273	TGT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003273	AT	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003273	T	7	7	1901	1907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003273	CCT	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17232878
35	NC_003273	CTT	2	6	2084	2089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17232878
36	NC_003273	ACC	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17232878
37	NC_003273	CAGCCC	2	12	2161	2172	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	17232878
38	NC_003273	T	6	6	2276	2281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003273	CAC	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_003273	CTT	2	6	2368	2373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_003273	TA	3	6	2398	2403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003273	GTA	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003273	TGAT	2	8	2457	2464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003273	AAC	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_003273	AAC	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_003273	T	6	6	2549	2554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003273	TC	3	6	2647	2652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_003273	ATT	2	6	2730	2735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003273	A	6	6	2839	2844	100 %	0 %	0 %	0 %	17232879
50	NC_003273	A	7	7	2879	2885	100 %	0 %	0 %	0 %	17232879
51	NC_003273	CAAC	2	8	2895	2902	50 %	0 %	0 %	50 %	17232879
52	NC_003273	TGC	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17232879
53	NC_003273	A	7	7	2929	2935	100 %	0 %	0 %	0 %	17232879
54	NC_003273	AGA	2	6	2988	2993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003273	TA	3	6	3025	3030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003273	TTA	2	6	3103	3108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232880
57	NC_003273	TGA	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232880
58	NC_003273	TGT	2	6	3225	3230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232880
59	NC_003273	GCTG	2	8	3269	3276	0 %	25 %	50 %	25 %	17232880
60	NC_003273	GTT	2	6	3294	3299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232880
61	NC_003273	CAA	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232880
62	NC_003273	AGC	2	6	3424	3429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17232880
63	NC_003273	T	6	6	3550	3555	0 %	100 %	0 %	0 %	17232880
64	NC_003273	CAA	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232881
65	NC_003273	GTT	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232881
66	NC_003273	TC	3	6	3759	3764	0 %	50 %	0 %	50 %	17232881
67	NC_003273	TC	3	6	3770	3775	0 %	50 %	0 %	50 %	17232881
68	NC_003273	TCT	2	6	3788	3793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17232881
69	NC_003273	CAACT	2	10	3825	3834	40 %	20 %	0 %	40 %	17232881
70	NC_003273	AGC	2	6	3846	3851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17232881
71	NC_003273	TCCA	2	8	3898	3905	25 %	25 %	0 %	50 %	17232881
72	NC_003273	TTA	2	6	4075	4080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232881
73	NC_003273	CAGC	2	8	4391	4398	25 %	0 %	25 %	50 %	17232881
74	NC_003273	TTC	2	6	4413	4418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17232881
75	NC_003273	T	6	6	4482	4487	0 %	100 %	0 %	0 %	17232881
76	NC_003273	TCACCT	2	12	4493	4504	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	17232881
77	NC_003273	CAA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232881
78	NC_003273	ACC	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17232881
79	NC_003273	GTT	2	6	4649	4654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232881
80	NC_003273	A	7	7	4695	4701	100 %	0 %	0 %	0 %	17232881
81	NC_003273	TCT	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17232881
82	NC_003273	GCA	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17232881
83	NC_003273	CCA	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17232881
84	NC_003273	GTCA	2	8	4827	4834	25 %	25 %	25 %	25 %	17232881
85	NC_003273	GAT	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003273	ATG	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003273	CAT	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_003273	GTT	2	6	5066	5071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003273	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003273	A	8	8	5355	5362	100 %	0 %	0 %	0 %	17232882
91	NC_003273	GGA	2	6	5381	5386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17232882
92	NC_003273	GAATG	2	10	5532	5541	40 %	20 %	40 %	0 %	17232882
93	NC_003273	GT	3	6	5606	5611	0 %	50 %	50 %	0 %	17232882
94	NC_003273	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17232882
95	NC_003273	TGG	2	6	5711	5716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17232882
96	NC_003273	GCA	2	6	5731	5736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17232882
97	NC_003273	CCAC	2	8	5818	5825	25 %	0 %	0 %	75 %	17232882
98	NC_003273	CACT	2	8	5866	5873	25 %	25 %	0 %	50 %	17232882
99	NC_003273	ATG	2	6	5947	5952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232882
100	NC_003273	ACC	2	6	5971	5976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17232882
101	NC_003273	AAG	2	6	6067	6072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17232882
102	NC_003273	TTGAA	2	10	6082	6091	40 %	40 %	20 %	0 %	17232882
103	NC_003273	CAA	2	6	6096	6101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232882
104	NC_003273	GGTCAC	2	12	6171	6182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17232882
105	NC_003273	GGGCGG	2	12	6236	6247	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	17232882
106	NC_003273	GATT	2	8	6251	6258	25 %	50 %	25 %	0 %	17232882
107	NC_003273	GCG	2	6	6342	6347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17232882
108	NC_003273	GCG	2	6	6369	6374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17232882
109	NC_003273	AAC	2	6	6429	6434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232882
110	NC_003273	CAA	2	6	6462	6467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232882
111	NC_003273	TGA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232882
112	NC_003273	CAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232882
113	NC_003273	AAC	2	6	6609	6614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232882
114	NC_003273	GGT	2	6	6675	6680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17232882
115	NC_003273	CTG	2	6	6708	6713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17232882
116	NC_003273	TTC	2	6	6716	6721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17232882
117	NC_003273	ACT	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232882
118	NC_003273	CAA	2	6	6930	6935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232882
119	NC_003273	AG	3	6	6964	6969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003273	AAT	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003273	A	8	8	7079	7086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003273	GAAT	2	8	7113	7120	50 %	25 %	25 %	0 %	17232883
123	NC_003273	AAT	2	6	7123	7128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17232883
124	NC_003273	GTA	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232883
125	NC_003273	A	6	6	7213	7218	100 %	0 %	0 %	0 %	17232883
126	NC_003273	AAG	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17232883
127	NC_003273	TTTGG	2	10	7267	7276	0 %	60 %	40 %	0 %	17232883
128	NC_003273	TA	3	6	7288	7293	50 %	50 %	0 %	0 %	17232883
129	NC_003273	AC	3	6	7335	7340	50 %	0 %	0 %	50 %	17232883
130	NC_003273	CA	3	6	7383	7388	50 %	0 %	0 %	50 %	17232883
131	NC_003273	CTTT	2	8	7414	7421	0 %	75 %	0 %	25 %	17232883
132	NC_003273	TAT	2	6	7520	7525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232883
133	NC_003273	TAT	2	6	7574	7579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232883
134	NC_003273	TAG	2	6	7598	7603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232883
135	NC_003273	TTA	3	9	7606	7614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232883
136	NC_003273	GTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232883
137	NC_003273	ACA	2	6	7665	7670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232883
138	NC_003273	CATTAC	2	12	7726	7737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232883
139	NC_003273	AAG	2	6	7742	7747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17232883
140	NC_003273	AT	3	6	7759	7764	50 %	50 %	0 %	0 %	17232883
141	NC_003273	A	6	6	7782	7787	100 %	0 %	0 %	0 %	17232883
142	NC_003273	A	9	9	7795	7803	100 %	0 %	0 %	0 %	17232883
143	NC_003273	TAT	2	6	7863	7868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232883
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145	NC_003273	ATG	2	6	7907	7912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232883
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268	NC_003273	TA	3	6	13237	13242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_003273	CA	3	6	13278	13283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
270	NC_003273	TGT	2	6	13298	13303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_003273	CTCAGT	2	12	13513	13524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_003273	GTT	2	6	13792	13797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232892
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279	NC_003273	GTT	2	6	13842	13847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232892
280	NC_003273	ATT	2	6	13904	13909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232892
281	NC_003273	G	6	6	13933	13938	0 %	0 %	100 %	0 %	17232892
282	NC_003273	CCT	2	6	14005	14010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17232892
283	NC_003273	C	6	6	14017	14022	0 %	0 %	0 %	100 %	17232892
284	NC_003273	CCT	2	6	14029	14034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17232892
285	NC_003273	C	6	6	14041	14046	0 %	0 %	0 %	100 %	17232892
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400	NC_003273	CTC	2	6	20948	20953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17232902
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409	NC_003273	ATT	2	6	21667	21672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232903
410	NC_003273	ACT	2	6	21721	21726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232903
411	NC_003273	AAAG	2	8	21850	21857	75 %	0 %	25 %	0 %	17232903
412	NC_003273	CAGGT	2	10	21967	21976	20 %	20 %	40 %	20 %	17232903
413	NC_003273	GGCTGA	2	12	21981	21992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17232903
414	NC_003273	CAA	2	6	22009	22014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232903
415	NC_003273	CAAA	2	8	22146	22153	75 %	0 %	0 %	25 %	17232903
416	NC_003273	GGT	2	6	22180	22185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17232903
417	NC_003273	GTT	2	6	22207	22212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232903
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419	NC_003273	CAGG	2	8	22225	22232	25 %	0 %	50 %	25 %	17232903
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422	NC_003273	TGAG	2	8	22382	22389	25 %	25 %	50 %	0 %	17232903
423	NC_003273	GGC	2	6	22397	22402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17232903
424	NC_003273	ACC	2	6	22453	22458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17232903
425	NC_003273	ATT	2	6	22485	22490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232903
426	NC_003273	CAA	2	6	22560	22565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17232903
427	NC_003273	A	7	7	22877	22883	100 %	0 %	0 %	0 %	17232903
428	NC_003273	AG	3	6	22954	22959	50 %	0 %	50 %	0 %	17232903
429	NC_003273	GA	3	6	22987	22992	50 %	0 %	50 %	0 %	17232903
430	NC_003273	T	6	6	23130	23135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_003273	CAG	2	6	23200	23205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_003273	AAT	2	6	23263	23268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_003273	TAT	2	6	23292	23297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_003273	AGA	2	6	23299	23304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_003273	CAT	2	6	23312	23317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232904
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438	NC_003273	AAAG	2	8	23524	23531	75 %	0 %	25 %	0 %	17232904
439	NC_003273	TTA	2	6	23578	23583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17232904
440	NC_003273	ATTG	2	8	23639	23646	25 %	50 %	25 %	0 %	17232904
441	NC_003273	AG	3	6	23659	23664	50 %	0 %	50 %	0 %	17232904
442	NC_003273	A	6	6	23703	23708	100 %	0 %	0 %	0 %	17232904
443	NC_003273	AT	3	6	23735	23740	50 %	50 %	0 %	0 %	17232904
444	NC_003273	TCTG	2	8	23855	23862	0 %	50 %	25 %	25 %	17232904
445	NC_003273	TGAA	2	8	23977	23984	50 %	25 %	25 %	0 %	17232904
446	NC_003273	GAACT	2	10	24053	24062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
447	NC_003273	CAG	2	6	24157	24162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17232905
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451	NC_003273	GAG	2	6	24245	24250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17232905
452	NC_003273	AAT	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17232905
453	NC_003273	TGG	2	6	24280	24285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17232905
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462	NC_003273	ATC	2	6	24585	24590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232905
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466	NC_003273	GGCT	2	8	24909	24916	0 %	25 %	50 %	25 %	17232905
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475	NC_003273	TTAC	2	8	25328	25335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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477	NC_003273	TGG	2	6	25403	25408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_003273	A	7	7	25497	25503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_003273	AAGC	2	8	26109	26116	50 %	0 %	25 %	25 %	17232907
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500	NC_003273	TAA	2	6	26671	26676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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